简单的来说眉毛种植术有以下四种并发症：

　　(1)种植当天，在眉周围，尤以额部上方会感到麻木不适，此为局部麻药所致。

　　(2)种植体部分不存活：这是由于适应证选择不当，或者分割单株时将单株毛发上到毛发移植针时，在此过程中夹捏，损坏了毛囊所致。必要时可考虑再次移植。

　　(3)形态不美：未按眉头、眉腰、眉梢的方向分别进行种植，因而导致眉毛向杂草一样丛生，此时可作部分眉拔出。

　　(4)眉毛稀疏：由于在移植过程不可能种的太密，否则种完一个单株后，在种另一个株时若隔得太近，将会把另一株的单株挤出切口。因此，对某些要求眉毛浓密的人来说会在种植后嫌眉毛稀疏。遇此情形，可在半年后再加密种植。